terça-feira, 28 de outubro de 2014

Organismo de investigação pico da Austrália libera boffinware livre para todos


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Da Austrália Commonwealth Scientific e Industrial Research Organisation (CSIRO), que relaciona o trabalho formativo atrás WiFi entre os seus sucessos, quer para aumentar a produtividade pesquisador, e publicou uma ferramenta científica livre-para-boffins chamada "Área de trabalho" para ajudar.


Workspace é projetado ser um ambiente genérico para os investigadores, por um lado, proporcionar um fluxo de trabalho colaborativo para coisas como modelagem científica com múltiplas entradas, ao mesmo tempo, tornando mais fácil para os pesquisadores para proporcionar a visualização de suas saídas.







Como a agência Dr John Taylor explica em comunicado da agência, os pesquisadores executam seus dados através de ambientes HPC pode encontrar muitas vezes que os seus próprios processos manuais, em vez de os computadores, tornam-se os pontos de estrangulamento.


"Os pesquisadores operar dentro de fluxos de trabalho semelhantes", diz ele, "os dados de abastecimento, analisando-lo, processá-lo ... Muitas vezes, isso envolve uma série de etapas repetitivas manuais."


Automatizar esses passos obtém o máximo de acesso do pesquisador para calcular, com o Dr. Taylor dizendo que "em uma aplicação, análise que anteriormente tomado duas semanas a conduta foi realizada em menos de uma hora".


Taylor aponta que o corte de código geralmente não é conjunto de habilidades primárias de um pesquisador, e que podem fazer a sua análise "ineficiente, propenso a erros, difícil de reproduzir por outros cientistas e inadequado para levar para o mundo comercial."


A idéia, o Dr. Taylor disse ao The Register, é livrar-se dos obstáculos que ficam no caminho da produtividade científica.


Editor de tela de fluxo de trabalho - Espaço de Trabalho do CSIRO

Editor de tela de fluxo de trabalho - Espaço de Trabalho do CSIRO. Imagem: CSIRO



Por exemplo, um fluxo de trabalho juntos para um ambiente de computação pode falhar em outro - não porque há um problema com o fluxo de trabalho, mas porque os pesquisadores não está computando os especialistas. Software escrito, compilado e executado em um cluster HPC Linux em Melbourne pode facilmente quebrar em uma máquina do outro lado do mundo, simplesmente por causa de dependências.


Erros mais sutis pode ter introduzido, Taylor disse, porque as correções de um segundo pesquisador implementa para obter uma análise para executar não são muito idêntico ao que foi implementado pela primeira vez.


"Ou o fluxo de trabalho do pesquisador é um conjunto complexo de instruções que execute 'ler esses dados, executá-lo, criar uma saída, usar essa saída como a entrada para outra análise, e assim por diante."


É fácil para alguém que tenta reproduzir os resultados de perder um passo - o que os leva de volta ao começo.


"A ferramenta de workflow encapsula todas essas etapas", disse ele, "e garante que você não perca algum aspecto sutil da análise."


Embora existam ferramentas de workflow comerciais que tentam resolver esses problemas, CSIRO está olhando para superar um par de deficiências específicas. Dr. Taylor disse um monte de ferramentas de workflow científicos são "construídas para áreas muito específicas da ciência". Além disso, a partilha ea colaboração entre pesquisadores pode ser difícil, simplesmente porque para dar a alguém o acesso mais para o mesmo fluxo de trabalho e os dados significa que alguém tem que comprar a licença.


CSIRO está oferecendo fluxo de trabalho como um download para resolver esse problema: ". Outro pesquisador pode executar a mesma análise do mesmo fluxo de trabalho e os dados e obter resultados idênticos - que faz fluxos de trabalho complexos reprodutível"


Pena de oito anos de esforço de desenvolvimento do CSIRO Digital Produtividade Flagship também ajuda com a publicação de pesquisa.


Os principais componentes da área de trabalho são um editor de fluxo de trabalho gráfico - com operações internas para coisas como looping, processamento de malha, visualização e análise de dados; um ambiente baseado no Qt integração Qt Designer para que os pesquisadores podem construir interfaces personalizadas para seus fluxos de trabalho; suporte para próprios plug-ins dos pesquisadores (juntamente com tutoriais e assistentes para ajudar com a codificação); suporte para uma paralela a execução remota e suporte de visualização 2D / 3D.


Existem versões para 32 e 64 bits do Windows e LSB 4.0 distribuições compatíveis com Linux e OSX 10.6 ou posterior. Descrição detalhada do CSIRO, aqui , inclui links para download. ®







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